تعتبر كلية الطب من الكليات الحديثة في جامعة كركوك حيث تأسست سنة 2005
حينما كلفت رئاسة جامعة كركوك آنذاك الاستاذ الدكتور (صباح محمد حميد زنكنه) مؤسس الكلية وعميدها الاول بتأسيس تلك الكلية حيث قام بالتعاون مع دائرة صحة كركوك ممثلة بمديرها العام السابق د. صباح امين احمد الداودي بتخصيص قاطع من الالمنيوم في داخل مستشفى آزادي التعليمي لبناية عمادة الكلية وقاعاتها وبعض مختبراتها واستقبلت الكلية الدفعة الاولى للعام الدراسي (2005-2006) وبرغم كل المعوقات والامكانات المحدودة واجهت العمادة تلك الصعوبات وعوضت نقص المختبرات لبعض المواد للمرحلة الاولى بتنسيق عال وتعاون من عمادتي كليتي العلوم والزراعة حينها حيث خصصت تلك الكليتين بعض مختبراتها لتدريس مواد الكيمياء والفيزياء والتشريح, استمرت عمادة الكلية بتجاوز الظروف وقلة الامكانات وضيق المكان وبدأت الجهود تنصب آنذاك لغرض تخصيص قطعة ارض قريبة من مستشفى آزادي التعليمي لتكون بناية ثابتة لموقع كلية الطب المستحدثة وبتنسيق وبجهد كبير بذله الاستاذ الدكتور (صباح زنكنه) والذي اثمر جهده مع دائرة الوقف السني في المحافظة التي وافقت على تاجير قطعة الارض المجاورة للمستشفى لكي تكون بناية لكلية الطب المستحدثة ومع اكتمال الدراسة للعام الدراسي الاول كان الجهد ومسابقة الزمن يتضاعفان لغرض انشاء الكلية على قطعة الارض المستأجرة حيث اثمرت تلك الجهود عن تعهد حكومة اقليم كردستان لبناء الكلية على تلك الارض وتم بالفعل وضع حجر الاساس للكلية الجديدة في سنة 2006 لكي يكتمل بناءها في العام 2008 وتنتقل مؤسسات وقاعات الكلية الى موقعها الحالي.